Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MRE11P49959 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MRE11P49959 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MRE11P49959 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MRE11P49959 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms