Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUP153P49790 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUP153P49790 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUP153P49790 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP153P49790 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP153P49790 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NUP153P49790 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUP153P49790 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUP153P49790 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms