Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLK1P49759 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms