Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GRIA4P48058 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GRIA4P48058 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms