Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ATRXP46100 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ATRXP46100 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATRXP46100 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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