Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RANGAP1P46060 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms