Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP2P42575 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP2P42575 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP2P42575 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP2P42575 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms