Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ITGAEP38570 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ITGAEP38570 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms