Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
FDFT1P37268 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
FDFT1P37268 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms