Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms