Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TGFBR1P36897 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms