Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXD12P35452 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXD12P35452 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms