Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
RCVRNP35243 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms