Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCKARP32238 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKARP32238 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKARP32238 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKARP32238 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCKARP32238 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCKARP32238 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms