Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
APOBEC3AP31941 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms