Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXC12P31275 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms