Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA7P31268 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA7P31268 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms