Protein–RNA interactions for Protein: P30532

CHRNA5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA5P30532 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHRNA5P30532 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms