Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LOXP28300 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LOXP28300 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LOXP28300 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms