Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PSMB9P28065 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PSMB9P28065 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms