Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CHMLP26374 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHMLP26374 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHMLP26374 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHMLP26374 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms