Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNA2P26232 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNA2P26232 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms