Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PRKCHP24723 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms