Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ITGA6P23229 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ITGA6P23229 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms