Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
EPHA1P21709 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms