Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CD247P20963 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CD247P20963 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CD247P20963 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CD247P20963 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms