Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SPI1P17947 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SPI1P17947 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SPI1P17947 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SPI1P17947 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms