Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCL3L1P16619 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCL3L1P16619 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms