Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MS4A1P11836 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms