Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CDK4P11802 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms