Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RARBP10826 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RARBP10826 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RARBP10826 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RARBP10826 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RARBP10826 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms