Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCL3P10147 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCL3P10147 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms