Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMIGD3P0DMS9 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms