Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TRAPPC2BP0DI82 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRAPPC2BP0DI82 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms