Protein–RNA interactions for Protein: P0CG08

GPR89B, Golgi pH regulator B, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR89BP0CG08 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GPR89BP0CG08 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GPR89BP0CG08 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms