Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CT47B1P0C2W7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CT47B1P0C2W7 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
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