Protein–RNA interactions for Protein: P08949

NMB, Neuromedin-B, humanhuman

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBP08949 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NMBP08949 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NMBP08949 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NMBP08949 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NMBP08949 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NMBP08949 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NMBP08949 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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NMBP08949 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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NMBP08949 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NMBP08949 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMBP08949 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMBP08949 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NMBP08949 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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