Protein–RNA interactions for Protein: P07288

KLK3, Prostate-specific antigen, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLK3P07288 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
KLK3P07288 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLK3P07288 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLK3P07288 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms