Protein–RNA interactions for Protein: P01817

IGHV2-5, Immunoglobulin heavy variable 2-5, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV2-5P01817 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
IGHV2-5P01817 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms