Protein–RNA interactions for Protein: O95873

C6orf47, Uncharacterized protein C6orf47, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf47O95873 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
C6orf47O95873 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
C6orf47O95873 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms