Protein–RNA interactions for Protein: O95236

APOL3, Apolipoprotein L3, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL3O95236 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
APOL3O95236 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL3O95236 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL3O95236 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL3O95236 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL3O95236 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
APOL3O95236 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms