Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SKAP2O75563 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms