Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
TIMM17BO60830 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms