Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GRIN3BO60391 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms