Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRAK2O60296 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRAK2O60296 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms