Protein–RNA interactions for Protein: O43927

CXCL13, C-X-C motif chemokine 13, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL13O43927 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CXCL13O43927 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CXCL13O43927 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms