Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CACNA1GO43497 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CACNA1GO43497 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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