Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SGSM2O43147 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SGSM2O43147 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms