Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KDM6AO15550 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms