Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CTDSP2O14595 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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